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CPGAVAS2|叶绿体注释工具

CPGAVAS2|叶绿体注释工具

作者: 维凡生物 | 来源:发表于2022-04-11 17:09 被阅读0次

嘀嘀嘀,今天小编给大家介绍的是叶绿体注释工具CPGAVAS2的使用方法,觉得有用的盆友可以收藏起来。

使用方法

01 从NCBI数据库中寻找最佳参考基因组

1、进入NCBI官网:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

image.png

2、进入页面后点击BLAST, 新页面出现后点击Nucleotide BLAST;


image.png
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3、在方框中输入序列的accession number或者提交序列文件后,点击左下角BLAST;


image.png

4、出现这个页面之后请耐心等待,你提交的序列越长速度越慢;


image.png

5、比对完成后出现下方页面,点击Evalue找到相似度最高的,点击相似度最高的结果对应的编号,下载对应的Genbank文件;


image.png
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6、点击这里查看下载的内容。


image.png

02 开始注释

1、首先打开注释网站:

http://47.96.249.172:16019/analyzer/home
选择AnnoGenome;

image.png

2、出现下面页面,按照要求填写信息;


image.png

3、填写和上传完成后就可以提交了;


image.png

4、提交完成后会出现如下界面,需要耐心等待10-20分钟左右;


image.png

5、运行结束会出现如下界面;


image.png

6、下拉至这里点击下载;


image.png

7、下载后解压即可。

(此推文仅供交流学习使用,侵权必删)

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