2021-06-23 剪接因子数据集

作者: NAome | 来源:发表于2021-06-23 21:43 被阅读0次

2021-06-23 剪接因子数据集
文献翻译--ASpedia:人类选择性剪切的综合百科全书
KnockTF:转录因子敲出/低的表达谱整合性数据库
R语言学习-双因素方差分析
11.2因子分析实践
59.关于调整因子的属性levels的order（一）
R语言与生信应用10-R语法-因子factor和缺失值
可变剪接
R语言入门2：数据结构-3
R--因子与表

剪接对于基因表达起着极其重要的作用，一方面通过调控可变剪接，可以拓展转录组和翻译组；另一方面异常的剪接与肿瘤等人类重大疾病密切相关。基于临床大数据的剪接异常分析对于探索疾病发病机制是一个重要的研究方向。原本今天是要分享一个比较全面的剪接因子数据库，检索发现有SpliceFac，SFmap和SpliceAid-F等，但这些数据库发表年限较长，无法满足更加全面的剪接因子分析。不过，在阅读文献的过程中发现两篇剪接因子相关研究论文，其中均收集整理了最新的剪接因子相关信息。文献信息如下：

（1）Zhang, D. et al. Intron retention is a hallmark and spliceosome represents a therapeutic vulnerability in aggressive prostate cancer. Nat Commun 11, 2089 (2020).

（2）Sebestyen, E. et al. Large-scale analysis of genome and transcriptome alterations in multiple tumors unveils novel cancer-relevant splicing networks. Genome Res 26, 732-744 (2016).

2021-06-23 剪接因子数据集
剪接对于基因表达起着极其重要的作用，一方面通过调控可变剪接，可以拓展转录组和翻译组；另一方面异常的剪接与肿...
文献翻译--ASpedia:人类选择性剪切的综合百科全书
摘要：选择性剪接通过增加表达的mRNAs的多样性赋予人类基因组复杂性。通过高通量数据集的差异选择性剪接分析，已经...
KnockTF:转录因子敲出/低的表达谱整合性数据库
今天介绍一个转录因子相关的数据库KnockTF，它提供了大量将转录因子（TF）敲出/低的人类表达谱数据集，以及转录...
R语言学习-双因素方差分析
双因素方差分析在双因素方差分析中，受试者被分到两因子的交叉类别组中。示例数据来源于ToothGrowth数据集-...
11.2因子分析实践
数据来源 11.2.1因子分析操作打开数据文件--分析--降维--因子--因子分析-- 将网点刘浏览量，论坛浏览...
59.关于调整因子的属性levels的order（一）
【上一篇：58.关于学习因子的一个有用的数据集gss_cat】[https://www.jianshu.com/p...
R语言与生信应用10-R语法-因子factor和缺失值
因子Factors 因子用来表示数据分组，可以有序或无序。因子可以视作带标签label的整型向量。因子可通过模型...
可变剪接
什么是可变剪接？可变剪接（Alternative Splicing，AS）是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接...
R语言入门2：数据结构-3
6. 因子（farcor）在R语言中，因子是用来处理分类数据的，分类数据又可以分为有序和无序。我们可以把因子简单...
R--因子与表
因子利用因子或者因子表，使用对应函数对数据框进行操作因子表中因子需要与x有相同的长度因子表的一部分是向量的话...