Linkedomics数据库使用介绍

Linkedomics

Linkedomics

属性（Attribute）是指待探索的基因、microRNA等；待查数据集（Search Dataset）指待筛选数据集的属性，包括RNA-seq、甲基化、突变和miRNA等；靶数据集（Target Dataset）指作为参照或总体的数据集；肿瘤队列（Cancer cohort）指研究的肿瘤类型。

以基因在数据库中的表达为例：

• Step 1 - 登陆账号（需要edu邮箱）
• Step 2 - 选择数据集：如肾上腺皮质腺癌 Adrenocortical carcinoma (ACC)
• Step 3 - 选择数据类型-HiSeq RNA(高通量RNA-seq)
• Step 4 - 可选项，数据要求，如肿瘤的分期分级
• Step 5 - 选择想要研究的基因
• Step 6 - 选择统计学方法，然后点击“submit query”如pearson correlationl test
• Step 7 - 生成后不是自动选择呈现的数据，要自动点击圆点后页面下方才会有结果显示。