等位基因通常有两种类型同源，一种是 IBD，另一种称为 IBS 。
IBD 指的是 Identity By Descent，即血缘同源。其含义是两个或者多个等位基因均遗传于同一祖先，且在此过程中不发生基因重组事件，则我们称此类等位基因具有共同血缘。又可以解释为，多个子代中共同拥有的一段或多段 DNA 区域或等位基因均从共同的一个祖先处获得。
IBS (Identical By State)，即状态同源。其含义是在某家系部分或者所有成员之间共有相同的遗传突变，且这些突变是在遗传过程中不断累积，所以我们在计算时只考虑到等位基因在家系成员之间的相似程度，而不在乎这些等位基因是否来源于共同的祖先。由其定义可知，IBS 在早期也与 IBD 相同，具有的等位基因来自于共同的祖先，在后期遗传进化过程中逐渐分离。
参考：
山羊群体重测序和GWAS分析
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