美文网首页
bcftools安装 以及 plink 安装

bcftools安装 以及 plink 安装

作者: 笺牒九州的怪咖 | 来源:发表于2021-11-17 10:46 被阅读0次

    bcftools安装

    1、下载

    下载地址:SAMtools/BCFtools/HTSlib - Downloads(http://www.htslib.org/download/)

    wget -c https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.14/bcftools-1.14.tar.bz2

    tar xjvf bcftools-1.14.tar.bz2

    2、编译

    cd bcftools-1.14

    ./configure --prefix=/where/you/software/bcftools_1_14/

    make

    make install

    3、写到环境变量

    echo 'PATH=$PATH:/where/you/software/bcftools_1_14/bin/:$PATH' >> ~/.bashrc

    source ~/.bashrc

    4、测试运行

    bcftools -h

    测试结果长成这个丫子,就说明你的bcftools安装成功啦!!!

    ————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————

    plink安装

    1、下载

    wget https://s3.amazonaws.com/plink1-assets/plink_linux_x86_64_20210606.zip

    2、解压

    unzip plink_linux_x86_64_20210606.zip       ###解压后直接使用,不需要编译

    3、配置环境变量

    echo 'export PATH=/home/gongjiangmei/software/plink/:$PATH' >> ~/.bashrc

    source ~/.bashrc

    4、测试运行

    plink  -h

    测试结果长成这个丫子,就说明你的plink也安装成功啦!!!

    ————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————

    相关文章

      网友评论

          本文标题:bcftools安装 以及 plink 安装

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/gclktrtx.html