美文网首页
augustus安装

augustus安装

作者: 灵动的小猪 | 来源:发表于2019-02-25 22:07 被阅读6次

    安装之前,需要安装的软件:boost,samtools,bcftools,bamtools,docker,htslib
    git clone https://github.com/Gaius-Augustus/Augustus.git
    tar -xzf augustus.current.tar.gz
    docker build -t augustus .
    修改bam2wig/Makefile,bam2hints/Makefile,filterBam/src/Makefile这三个文件
    make BAMTOOLS=/home/zhan/biosoft/bamtools-master
    export PATH=$PATH:/augustus/bin:/augustus/scripts

    ps:
    下载和安装docker的步骤和方法
    安装过docker以后,已经创建了一个docker群组,需要把用户添加到这个群组就可以使用了

    usermod -G docker username #添加用户到组
    newgrp docker #更新群组

    参考

    Augustus
    docker安装
    boost/shared_ptr.hpp: 没有那个文件或目录
    BUSCO - 组装质量评估
    Docker启动Get Permission Denied
    ubuntu下docker添加国内镜像
    Docker镜像构建文件Dockerfile及相关命令介绍
    linux spec user: Unable to find user xxx

    相关文章

      网友评论

          本文标题:augustus安装

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/vpmnyqtx.html