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觉得孟叔这次的前面介绍非常的棒了，基本上把IGV从简单介绍到安装都讲的很清楚。这次主要尝试的是对Bam文件的可视化~
大家可以看看孟叔对于IGV的简单介绍和使用，这次关于内容主体的补充没啥，初步了解IGV的入门操作是足够的！详情：https://zhuanlan.zhihu.com/p/36703085
BAM文件及BAM index文件
链接：https://pan.baidu.com/s/1YOv2FBwmPVKm2EG7TYl0jg 密码：m32y
直接上问题：
1：请大家安装并调试好IGV Tools并使用我们给出的BAM文件，载入到IGV Tools中，观察mapping的结果，并找出1个你认为比较可信的mutation 位置，并说出你为什么认为这个点就是一个mutation 位点。
首先把文件导入到IGV里面，然后直接看看结果。
结果如图所示，显示差异颜色的代表测到的reads不一样。
A为58%
C为38%
从这两个位点来看，第一个突变率会更高一点。
2：请根据你的观察，总结一下A G T C四种碱基都使用什么颜色表示？
A 绿色
T 红色
C 蓝色
G 棕色
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