大家好，欢迎收看《文采斐然》第一期。本栏目主讲人是浙江大学博士，联川生物重测序负责人——韩斐然，。在《文采斐然》这档短视频节目里，每一期将由韩博为大家来介绍一篇生物学的相关文献，并简述文献当中的亮点。因为做研究的各位都清楚，文献阅读是我们研究工作当中必不可少的一环，如果能从或者经典或者前沿的文献当中寻找到一丝灵感的话，那么我们的研究工作将会有一个巨大的推进。
今天要给大家推介的是今年5月发表在Science上的、由中科院古脊椎所付巧妹团队撰写的古东亚人DNA测序论文——《Ancient DNA indicates human population shifts and admixture in northern and southern China》。
相对于常规的基因组学研究，本研究最大的突破就在于他们对将近1万年前的古人类DNA进行了提取和测序，从而我们就能够对原始的古人类基因组直接进行研究，而不是依赖于现代数据对它们进行推测或重构，这就为拼图补上了非常重要的一块。
该团队在古DNA提取和测序这方面已经有持续近10年的探索，他们在2013年发表的PNAS论文当中就有涉及到这部分内容。具体来说，他们巧妙地利用了单链文库制备和液相捕获等技术来巧妙地规避了微生物基因组污染、古DNA高度降解等重重困难来将研究结果完整地呈现在我们面前。
液相捕获技术大家可能知道，它在，比如说人的全外显子组等技术上有一个比较广泛的应用，但是应用在古人类的DNA上还是比较少见的，是液相捕获技术的一项重要拓展。
那么具体到分析内容层面，研究者在拿到了古东亚人DNA的测序数据以后，首先将它们和已经发表的古东亚人基因组以及现存的东亚人基因组放在一起进行了群体结构分析，对古代东亚各地不同人群的进化关系进行了一个梳理。同时，也对现存的各种进化假说进行了验证或者修正。其中我们可以发现，不仅古代东亚的各个族群之间彼此亲缘关系比较近，而且他们和南岛语系的人，比如说东南亚的土著人群这样一些人种的关系，也非常接近，确认了南岛语系的祖先是来源于福建一带的古南方人群。
我们可以从左侧的主成分散点图和右侧的遗传相似性热图来看出各个族群彼此之间相当接近的亲缘关系。同时，本文还通过基因流分析等描述了古代东亚各个族群之间的迁移和融合。结果显示，古代南方人群和古代北方人群之间的遗传成分存在着相互的影响，也就是说，存在着古代南方人群迁移到北方这样一个现象，也存在着古代北方人群迁移到南方的这样一个现象，为华夏民族的溯源提供了一个重要的证据，说明了古代东亚人群在进化上具有很强的连续性。
本文还包含了许多其他的重要结论。从分析方法上我们也可以看出，虽然主要是一些经典的群体结构类分析，但是在结论推理以及扩展和讨论等方面确实是下足了功夫的。我们可以看出，课题组在这方面有着非常深入的钻研。
那么今天的文献推介就到这里，希望大家都能够找到你的灵感。
文献解读：古东亚人群体结构【文采斐然 01】_腾讯视频
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