美文网首页HLA分型
HLA Dictionary-Allel和抗原之间的对应关系

HLA Dictionary-Allel和抗原之间的对应关系

作者: 生信修炼手册 | 来源:发表于2018-08-24 20:04 被阅读1次

    欢迎关注"生信修炼手册"

    HLA Dictionary , 中文名叫做HLA 字典,记录了HLA-A, -B, -C, -DRB1/3/4/5 和 -DQB1 等HLA基因的不同Allel 对应的血清学分析鉴定的抗原。

    最新版本于2008年发布,共包含了832个HLA Allel对应的血清学抗原信息,其中, I 型HLA 基因有685条记录,II 型HLA 基因有147条记录。该文件以PDF的形式保存,链接如下

    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/j.1399-0039.2008.01183.x

    在该文件中,除了专家团队定义的抗原名字外,还包括了世界卫生组织WHO和国际细胞交换组织UCLA等其他机构定义的名称,示意如下

    在IMGT/HLA 数据库中,提供了检索HLA Dictionary 的功能,网址如下

    https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/dictionary.html

    用法也非常简单,在输入框中输入需要检索的记录,然后点击右边的按钮检索即可

    支持三种格式的数据

    1. HLA Allel

    2. Expert Assigned Type

    3. WHO Assigned Type

    以HLA Allel为例,输入数据A*01:01, 检索结果如下

    由于结果列数较多,可以勾选对应的列,来展示感兴趣的列。

    在HLA分型结果中,除了提供HLA Allel之外,有时还需要提供对应抗原的信息,就可以通过这个方法得到。

    扫描关注微信号,更多精彩内容等着你!

    相关文章

      网友评论

        本文标题:HLA Dictionary-Allel和抗原之间的对应关系

        本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/gkviiftx.html