单细胞测序分为
- 单细胞基因组测序: scDNA-seq
- 单细胞转录组测序:scRNA-seq
- 单细胞表观遗传测序:scATAC-seq
scATAC-seq通过鉴定开放的染色质区域来研究染色质结构的动态重塑,有助于揭示转录的内在机制
Bulk RNA-seq:即传统的(大量细胞或组织的)转录组测序技术
植物单细胞数据库:
- PCMDB https://www.tobaccodb.org/pcmdb/homePage
- plantscrnadb http://ibi.zju.edu.cn/plantscrnadb/index.php 这个网站似乎经常崩溃
- scplantdb https://biobigdata.nju.edu.cn/scplantdb/marker?species=zea_mays 这个数据库很全面,物种比较多
PCMDB界面如下
PCMDB主页
plantscRNAdb主页
scPlantDB主页
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