美文网首页
monocle画图中屏幕上的数据如何储存

monocle画图中屏幕上的数据如何储存

作者: SCU十一 | 来源:发表于2020-05-13 15:46 被阅读0次

    1.问题描述:使用monocle的plot_genes_branched_heatmap命令,画出图

    但是每一个cluster是哪些基因ID?

    2.解决方法:画图命令增加“ return_heatmap = TRUE”。就会在屏幕上输出,每个基因对应的分支号,然后每一支挑一些有代表性的写一下。

    3.拓展,在屏幕上复制太麻烦了,并且太多了,怎么办呢?使用“sink”命令,如下:

    sink("a.txt")

    plot_genes_branched_heatmap(HSMM[branch_gene], branch_point = 1, num_clusters = 6,cores = 8,return_heatmap=TRUE)

    dev.off()

    sink()

    问题解决了!屏幕不会输出之前的信息,而全部储存到a.txt里面!在里面搜“annotation_row”,后面就是基因和cluster的信息!

    相关文章

      网友评论

          本文标题:monocle画图中屏幕上的数据如何储存

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/hdbnnhtx.html