R小盐准备介绍那些小众又好用的生信数据库
你想要的R语言学习资料都在这里， 快来收藏关注【科研私家菜】
今天R小盐介绍的数据库是BioLINCC数据库
01 BioLINCC数据库介绍
BioLINCC，即生物标本和数据采集信息中心（Biologic Specimen and Data Repositories Information CoordinatingCenter），是2008年由NHLBI建立的数据库，旨在帮助科研人员更便捷地获取研究数据，同时提高NHLBI资助项目的转化率。BioLINCC数据库包含两类数据，一是NHBLI生物标本数据，这类数据自1975年开始由血液疾病部门（Division of Blood resources）管理，一类是NHBLI数据，这类数据自2000年开始由心血管科学研究中心（Division of CardiovascularSciences）管理。
国家心脏、肺和血液研究所(NHLBI)生物标本和数据库由两个实体组成:NHLBI生物标本库(NHLBI生物材料库)，由NHLBI血液疾病和资源处(DBDR)输血医学和细胞治疗处管理；NHLBI数据库，由NHLBI心血管科学处(DCVS)流行病学处管理。这两个项目一直有一个相似的使命，即通过向合格的研究人员提供对存储的生物样本和数据集合的访问，加强和促进心血管、肺部和血液疾病的进一步研究。
02 BioLINCC数据库使用
BioLINCC提供了NHLBI临床注册研究和流行病学研究的大量信息，既包含研究总结、参考文献和研究方案，也包含相关研究的深度信息，包括相关研究的延伸信息、BioLINCC模板以及利用该研究数据发表的文献集合。用户如申请相关数据，应成为注册用户。BioLINCC网站导航栏包括生物标本和数据资源（Biospecimen andData resources）,使用手册和表格（Proceduresand Forms）,新建或提交数据库（Build/submitNew Collection）。
NHBLI生物标本数据库负责获取、储存生物标本，同时将质量合格的生物样本分配给科研人员。早期BioLINCC生物数据库的标本主要包括血浆、血清以及全血，这些标本来源于研究供血和受血患者的几项临床研究。近几年，生物数据库还包含了来源于心血管、肺部疾病以及血液系统疾病研究的标本。 NHBLI临床研究数据主要来源于最近70多年以来的流行病学研究和临床研究，包含来自于145家中心临床注册研究和观察性研究的数十万患者数据。来源于临床注册研究的数据包含患者基线资料、中期随访信息、辅助研究以及预后资料（包含实验室检查）。流行病学研究数据包含在整个观察周期内获得的所有监测结果。其中部分数据集未必包含原始数据（比如心电图各导联信息、食物热量数据），这些原始数据将被整理成一些汇总数据或指标。研究人员或NHBLI认为无效的数据不能被提交至数据库。
许多临床和流行病学研究的研究数据集和/或生物标本目前作为开放期收集提供。其中大多数只有研究数据集; 有些同时拥有研究数据集和生物标本; 还有一些拥有有限的小瓶角色塑造数据但没有完整的研究数据集的生物标本。
【生物标本和数据资源】工具栏包含概论（overview）,BioLINCC数据来源的研究（studies）,教学数据集（Teaching datasets）,已申请数据再次使用申请说明（renew Existing Data UseAgreement）,BioLINCC数据库相关文献（Publication)，NIH资助机会(Funding Opportunities)、非BioLINCC资源(Non-BioLINCC Resources)。其中教学数据集是指无需付费即可免费使用的数据资源（需注册），包括Framingham Heart Study，DigitalisInvestigation Group (DIG)，Childhood Asthma ManagementProgram (CAMP)这三项研究的数据。已申请数据再次使用申请说明，是指BioLINCC数据申请之后3年内失效，无法再次直接使用，申请者如需再次使用，应重新提交使用申请。【使用手册和表格】工具栏包含BioLINCC使用手册（BioLINCC Handbook）、数据使用申请表格（Forms）、批准使用同意书（Aggreement Templates）。
数据库引用：
BioLINCC
https://www.sohu.com/a/200376012_373785
关注R小盐，关注科研私家菜(VX_GZH: SciPrivate)，有问题请联系R小盐。让我们一起来学习 生物信息在线数据库
网友评论