构建侵染性克隆 (Bhat and Rao, 2020)
侵染性克隆是一个全长cDNA(FL-cDNAs)克隆,在合适启动子配合下可以在离体或活体条件下产生侵染性转录本。构建侵染性克隆是研究功能基因组学,病毒蛋白的复制和表达以及宿主与病毒相互作用的基础。另外,侵染性克隆还是抗病毒研究和新病毒载体研究的材料库。
主要有两种构建方法:
(1)利用T3,T7或SP6启动子(噬菌体的RNA聚合酶)体外转录。一些商品化的载体(比如promega的pGEM-T easy)就含有这类启动子
(2)另一类就是通过 cauliflower mosaic virus(CaMV)35S启动子实现体内转录。关于这个启动子的发现历史,有一篇文章已经介绍的很全面,我就不多说了(https://zhuanlan.zhihu.com/p/43940274)。
在找构建病毒侵染性克隆实验方法的时候,发现了一本写满methods and protocol的书(满意!)。这本书以植物病毒为例,介绍了详细的实验原理和方法。其中侵染性克隆的部分在449-463页,我刚刚上传到百度网盘,有需要的话可以下载。
Bhat, A.I., andRao, G.P. (2020) Development of Infectious Clone of Virus. In Characterization of Plant Viruses:Springer, pp. 449-463.
链接:https://pan.baidu.com/s/14S1VbRf8jgnaBjavAF0bdw
提取码:1bo3
一个构建的流程图
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【现学现卖】构建具有侵染性的病毒克隆(主要是列举了几篇文献的构建思路,没有具体步骤)
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