数据结构
1. 知识点
(1)R的赋值符号<-
(2) 在Console控制台输入命令,相当于Linux的命令行
(3)R的代码都带括号,而且必须是英文格式下的括号
(4)getwd () 显示工作的路径
(5)向量(Vector)是由元素组成的,元素可以是字符串或者数字
(6)R语言中的数据框(Data frame)就是表格
(7)函数或者命令不会用时,除了百度和谷歌,?read.table
重点:向量(vector)
a. 向量可以是数值,字符,逻辑等。
常见的向量类型b. 向量元素的添加及合并
常用函数为c(),append()
c. 向量批量序列的生成
seq(length=, from=, to=).
length:指定生成个数;from:是指开始生成的点;to:截止点。如果不指定,则默认条件 下:seq(N1,N2,BY=),其中,n1:开始位置;n2:截止位置;by=指定间隔,
rep() rep(P,N) 重复生成P值N次;2.rep(a1:a2,a1:a2) #重复a1到a2,按a1产生a1 次,按a2产生a2 次
d. 向量排序 sort(); 输出排序后的结果;order();输出排序后的各个向量位置,
学习了一丢丢,感觉信息量很大。
重点之-数据框
数据框(Data Frames)是一种特殊的列表,其中所用元素长度都相等,列表中的每个 元 素都可以看作一列,每个元素的长度可以看作行数。
创建显式数据框的方法是data.frame()
额,上面的内容是自己搜索扩展part1:向量
1. 标量和向量的区别
元素指的是数字或者字符串(用chr表示)等
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
注:最后一次赋值是最后的结果.
2. 从向量中提取元素
(1)根据元素位置
x[4] #x第4个元素
x[-4]。#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4] #第2到4个元素
x[-(2:4)] #除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
(2)根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x %in% c(1,2,5)]。 #存在于向量c(1,2,5)中的元素
part: 数据框
卡在了第一步。额。汗!!
终于等到你,还好我没放弃(1)读取本地数据
read.table(file = "doudou.txt",sep ="\t",header = T)
(2)设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1) #最后row.names的意思是修改第一列为行名
(3)数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
(4)变量的保存与重新加载
#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData") #保存其中一个变量load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
(5)提取元素
- X[x,y] #第x行第y列
- X[x,] #第x行
- X[,y] #第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b] #第a列到第b列
- X[c(a,b)]. #第a列和第b列
- X$列名. #也可以提取列
(6)直接使用数据框中的变量
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)
小技巧
attach
将数据框名添加到搜索环境中:attach(a),作图时就只需输入列名(连$都不用了)
做完后将a删除出搜索环境 detach(a)
局限性:两个以上数据框的列名有冲突时,同时attach会报错。
with
with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values)
#求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量,也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x
脚本文件的后缀就是R,在R语言里还是很在意后缀的。
save(X,file="test.RData")
出现报错:object X not found,
为什么?字面意思:没有找打X,保存变量X时出了问题,解决方法:额。
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