- Seurat 格式转换成SingleCellExperiment
library(sceasy)
sceasy::convertFormat(seurat_object, from="seurat", to="sce", outFile='filename.rds') - Seurat 转换成 AnnData
sceasy::convertFormat(seurat_object, from="seurat", to="anndata", outFile='filename.h5ad')
library(sceasy)sceasy::convertFormat(seurat_object, from="seurat", to="sce", outFile='filename.rds')
sceasy::convertFormat(seurat_object, from="seurat", to="anndata", outFile='filename.h5ad')
Seurat 格式转换成SingleCellExperimentlibrary(sceasy)sceasy::co...
随着单细胞技术的成熟，单细胞数据也在日益增长，这将为单细胞数据科学奠定数据基础。在不远的将来，单细胞数据挖掘也将成...
scater package应该是目前单细胞数据QC功能最为齐全强大的包了，然而在对数据集进行转换后，总会出现ex...
2022-06-17
一文了解单细胞对象数据结构/数据格式，单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构， 内容构...
最近看到Fly Cell Atlas (FCA) 公布果蝇的多个组织的单细胞核转录组测序数据，虽然FCA组织提供了...
随着单细胞数据的爆发时增加，传统的科研人员如何方便的探索单细胞数据，成了急需解决的问题，数据解读才是未来单细胞方向...
signatureDB - B cell数据库CancerSEA - 癌症单细胞KIT（肾脏单细胞数据库）：htt...
我们知道单细胞数据的激增和它的高维特征催生了针对单细胞数据的数据格式：Seurat对象、singlecellexp...
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一） Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（二） Hemberg...
本文标题：2022-06-17 单细胞数据转换
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/htkhvrtx.html
网友评论