今天在一个群里回答一个问题，关于genespring处理后的表达矩阵，有负值。此前做过一次Agilent芯片的分析，用的正是类似数据。其实就是已经标准化的数据，且log2转换过。且limma接受的就是log2转换过的表达矩阵，然后均值，t检验，P值，P值校正，这就是所谓差异分析的内在原理。
结果回答完问题，给我发了1.83的红包，omg,咱还得跟另外一小伙伴分。 换位思考才会理解，新手小白，尽量避免做伸手党，有问题先自行查资料解决，实在不可，希望寻求他人帮助，也要有诚意，该小伙伴做都没做就说负值有报错，足见自己都不愿为自己的问题付出心力，奈何求人。
今天在一个群里回答一个问题，关于genespring处理后的表达矩阵，有负值。此前做过一次Agilent芯片的分析...
关于limma包差异分析结果的logFC解释 http://www.bio-info-trainee.com/12...
前言 limma的全称是：Linear Models for Microarray Data 需要阅读limma的...
记录的除工作之外的事情。 1 答疑一位朋友关于拆书法的问题。A2 是否对接下来的便签写法给大家进行一次培训或者交流...
setwd("E:/GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分...
2.1 引用limma Limma执行了作者和合作伙伴的一系列方法论研究。在出版物中使用limma软件的结果时，请...
Hi式复盘 Day 7/365 2019.01.20 【记录】 听《【答疑课4】时间有限，如何完成计划？》，再一次...
limma的输入表达矩阵要求是经过log2处理之后的GEO中的Series Matrix File(s)通常是经过...
芯片数据差异分析，常规用limma进行差异分析，而对于RNA-seq数据，常用edgeR、DEseq2和limma...
本文持续更新，为付费用户提供答疑，答疑微信/QQ：1816863528。 更新记录 2019-3-6，共15题。 ...
本文标题：记录一次答疑-关于limma
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/hxlurqtx.html
网友评论