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利用Uniprot网站对基因信息名称进行基因Uniprot ID

利用Uniprot网站对基因信息名称进行基因Uniprot ID

作者: 翾格格 | 来源:发表于2021-03-10 14:56 被阅读0次

前两天介绍了KEEG数据库,我们通过该数据库对单个基因进行信号通路查询,其实我们可以利用KEEG中的“Analysis Tools”中的“KEGG Mapper”可以对多个基因相互作用的信号通路进行检索。但是进入“KEGG Mapper”界面,我们搜索的基因只能通过基因的四种类别进行搜索,分别为“KEGG identifiers”“NCBI-GeneID”、“NCBI-ProteinID”和“Uniprot”,这里我们将介绍一下怎么将基因名称转化为Uniprot。

第一步:登陆Uniprot网站,网址:http://www.uniprot.org/, 点击“Retrieve/IDmapping ”.

第二步:填写你需要转换的基因名称,选择转换格式,如From“Gene name”To“UniprotKB”,选择相应的物种,在Organism中选择。运行“Submit”。

第三步:跳出“UniprotKB results”界面显示查询的结果(注:可能出现部分基因查询不到,也有可能出现一个基因名对应好几个编码,根据你需要查询的基因进行选择)。点击“Reviewed Swiss-Prot”,进行“Download”,可以选择多种存储格式,通常选择“Excel”,在新生成的Excel表格中,“Entry”该栏目对应的就是你需要查询的Uniprot ID。

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