将基因组组装到染色体水平无非就是两种方式: 独立组装(de novo); 基于参考基因组的组装(reference...
SOAPdenovo是一个新颖的适用于组装短reads的方法,能组装出类似人类基因组大小的de novo草图。 1...
SOAPdenovo是一个新颖的适用于组装短reads的方法,能组装出类似人类基因组大小的de novo草图。该软...
Bionano数据既可以自己从头de-novo出图谱,也可以依据参考序列混合组装出图谱。 ===从头组装==== ...
1. 组装基因组质控 得到组装好的基因组序列之后,首先要使用多种方法评估组装质量。这里用到2款可用于基因组组装质量...
从头组装- de novo assembly 指在不需要任何参考序列的情况下对某一物种进行基因组测序,然后将测得的...
Flye软件简介 Flye是美国加利福尼亚大学圣迭戈分校开发的针对三代测序数据的基因组de novo组装的生信软件...
细菌基因组组装金标准:GAGE-B 组装软件的选择 细菌基因组组装的目标不同于大型生物基因组的组装,大型基因组组装...
主流的NGS基因组组装软件都是先将序列划分成kmer, 然后基于de Bruijn Graph图论算法,得到组装好...
BioNano以cmap格式存放光学图谱,为了评估基因组的组装质量或者了解光学图谱中冗余情况(高杂合基因组组装结果...
本文标题:De novo组装#08 | 基因组组装评估
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