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安装 EMBOSS

安装 EMBOSS

作者: ytbao | 来源:发表于2022-06-14 23:08 被阅读0次

服务器是 CentOS 

# fir      cycas装不上,在fir上装上了
mkdir /home/ytbao/bin/EMBOSS

cd /home/ytbao/bin/EMBOSS

wget ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/EMBOSS-6.6.0.tar.gz

tar zxfv EMBOSS-6.6.0.tar.gz

cd EMBOSS-6.6.0

./configure

make

# 切换root用户账号

su - jfmao

password:xxxxxxxxxxx

sudo make install

# 安装完成后测试一下:

wossname -auto|les

# 如果出现很多程序的名字,说明安装成功了

# 子程序在 /home/ytbao/bin/EMBOSS/EMBOSS-6.6.0/emboss/      写进环境变量:

echo 'PATH=$PATH:/home/ytbao/bin/EMBOSS/EMBOSS-6.6.0/emboss/' >> ~/.bashrc

source ~/.bashrc

# shuffleseq -h 或者 /home/ytbao/bin/EMBOSS/EMBOSS-6.6.0/emboss/shuffleseq -h

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