美文网首页生物信息学
EMBOSS整个软件包安装

EMBOSS整个软件包安装

作者: bioinfo2011 | 来源:发表于2018-10-05 22:12 被阅读19次

Emboss(The European Molecular Biology Open Software Suite)该软件包源于1988年开始开发的EGCG系统,是一个开放源代码的序列分析软件包。该软件包含160多个小型程序,涵盖序列比对、快速数据库搜寻序列、蛋白质模序及结构域分析、表达序列标签(EST)分析、核酸序列分析(例如CpG岛的识别)等多个领域。

emboss功能

序列比对

快速搜索数据库

蛋白质模块分析

核苷酸序列分析,包括寻找CpG岛,寻找重复

序列等。

小基因组的编码区分析,如寻找开放阅读框,

寻找EST等。

序列模式识别与翻译

安装emboss 6.5.7

安装plot 4.4

wget http://nchc.dl.sourceforge.net/project/gnuplot/gnuplot/4.4.0/gnuplot-4.4.0.tar.gz

tar zxvf gnuplot-4.4.0.tar.gz

cd gnuplot-4.4.0

./confugure

make

sudo make install

安装emboss依赖

sudo yum install libX11-devel

sudo ln -s /usr/lib/libX11.so.6 /usr/lib/libX11.so

sudo yum install libpng-devel

sudo yum install dvipng

sudo yum install libpng-devel

安装emboss

wget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/unix/EMBOSS/EMBOSS-6.6.0.tar.gz

tar -zxvf EMBOSS-6.5.7.tar.gz

cd EMBOSS-6.5.7

./configure

make

sudo make install

本文参考自 :https://blog.csdn.net/herokoking/article/details/70239881

相关文章

  • EMBOSS整个软件包安装

    Emboss(The European Molecular Biology Open Software Suite...

  • 安装 EMBOSS

    服务器是 CentOS # fir cycas装不上,在fir上装上了mkdir /home/ytbao/bi...

  • 获得DNA的反向(互补)序列

    本方法依赖于emboss,安装方法: 使用方法:

  • apt-get 命令概述

    安装软件包 重新安装软件包 修复安装软件包,"-f = ——fix-missing" 删除软件包 删除软件包,包括...

  • 【Linux】apt-get工具的使用

    在库里面查找软件包 安装库中的软件包 删除软件包 更新库中的软件包 列出已安装的软件包列表 判断软件包是否安装 显...

  • Nginx入门使用

    安装 yum install -y nginx(没有软件包需安装软件包) 安装软件包创建文件:vi /etc/yu...

  • emboss

    ./configure --prefix=/home/huangle/EMBOSS --without-x

  • RPM包管理

    RPM包管理 1、软件包安装 2、软件包升级 3、软件包卸载 4、软件包查询 5、软件包校验 1、软件包安装 rp...

  • Ubuntu16.04 常用命令集合

    软件安装 方法一: 方法二: deb软件包可直接安装 deb详解: 方法三: rpm软件包安装Ubuntu的软件包...

  • ubuntu软件包相关命令

    安装和删除 安装软件包 删除已安装的软件包(保留配置文件),不会删除依赖软件包,且保留配置文件。 删除已安装包(不...

网友评论

    本文标题:EMBOSS整个软件包安装

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/fohcaftx.html