美文网首页
生信入门学习顺序

生信入门学习顺序

作者: 野生拟南芥 | 来源:发表于2019-07-23 08:57 被阅读0次

    1、安装linux虚拟机,学习常用命令(2 d)

    cd
    ls
    mkdir
    rm
    pwd
    ln -s
    vi
    sh
    less
    cat
    sort
    grep
    awk

    2、学习linux运行程序的基本方法(1 h)

    sh运行文件
    screen的使用
    如何向程序传递参数

    3、学习xshell和filezilla的使用(0.5 h)
    4、在服务器上运行fastqc对二代测序结果进行质控(2 h)
    5、将质控结果传输到本地查看(0.5 h)
    以上是linux系统的最基本知识
    ========
    6、学习python脚本的写法

    简介
    运算符
    字符串
    列表
    字典
    文件操作

    7、python脚本练习

    将某个fasta文件的序列反向互补
    统计三代测序fasta文件(总长,reads数,最长和最短reads长度,N50长度)

    相关文章

      网友评论

          本文标题:生信入门学习顺序

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/izbglctx.html