根据中国农大邓学梅老师的动物遗传学课程整理(此部分张浩老师主讲,慕课网)。
1 数量遗传的历史
大致分为三个阶段:
1.1 第一阶段:1920~1960
理论体系生产阶段,主要使用统计学和Mendelian遗传学结合,代表人物有:Fisher,Wright, Lush, Falconer等。
主要内容:
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数量遗传学理论体系生产的标志:1960, Falconer数量遗传学导论的出版
1.2 第二阶段:1960~80年代中期
主要使用混合模型方程组理论和方法的发展和应用(计算机引入),代表人物:Henderson, Robertson, Hill等。
最主要提出了动物模型:
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1.3 第三阶段:80年代中期~
分子数量遗传学诞生,并且与传统数量遗传学结合
主要内容:
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2 数量遗传学主要研究内容
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3 性状划分
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3.1 数量性状的遗传特点-多基因假说
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3.2 数量性状的遗传分析
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3.3 数量性状的遗传剖分
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显性效应可能发分离,上位效应可能会重组。
加性效应可以稳定遗传。
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4 遗传参数
有三个最重要的遗传参数:遗传力,重复力, 遗传相关
4.1 重复力
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重复力的应用:
1) 判断遗传力估计是否正确,其是遗传力的上限
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2 )确定度量的次数
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3 )估计个体终生可能生产能力
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4.2 遗传力
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一般使用狭义遗传力
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遗传力的应用
1) 估计育种值
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2 )制定性状间无相关时的选择指数
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3) 预测选择效果
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4) 确定选择方法和方案
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4.3 遗传相关
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遗传相关的应用
1) 间接选择
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2 )制定性状间有遗传相关时的选择指数
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计算b:
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5 亲缘相关系数
在任一基因座上的两个等位基因同源相同的概率
6 分子数量遗传学
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7 QTG和QTN
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研究步骤:
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例子:
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应用: 分子标记和基因编辑
8 GWAS
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遗传标记类型有: SNP, InDel(插入缺失), 结果变异(SV)。
2005年首次在Scinece报道
流程:
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局限性:
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GWAS分析:
足够大的样本, 基因组数据,系谱,表型
9 GS 基因组选择技术
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9.1 概念:
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9.2 步骤:
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9.3 SNP分型:
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9.4 GS算法
-
间接法:
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-
直接法:
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9.5 影响GS准确性
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9.6 GS的应用
牛:
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我国是在2010开始,北京地区的牛生产水平提高
猪:
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温氏做了一些
鸡,羊也做了很多。
我国的芯片(GS应用):
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