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TCGA JASON文件对应样本名和文件名

TCGA JASON文件对应样本名和文件名

作者: 蓝天_乎乎 | 来源:发表于2019-01-14 13:34 被阅读0次

    TCGA JASON文件对应样本名和文件名

    参考:https://www.jianshu.com/p/470791a77a1a

    http://www.sohu.com/a/220323319_653813

    谢谢果子老师代码

    image.png

    以上是2个文件用},{分割

    image.png

    1 进入TCGA下载表达量的文件中用cmd tree/F查看树形图

    2 和jason对比,找到“file_id”--"file_name" ,以及对应的“entity_submitter_id“(TCGA名)如下图。


    image.png

    知道关系后可以用R读取,进行对应!!!


    image.png

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