id=TCGA.READ.muse.ec8ec3ad-f08d-46eb-9571-42806e304b37.DR-10.0.somatic.maf.gz
zcat $id|grep -v '^#' |cut -f 16 |sort -u |grep "^TCGA" >> READ.list
cat READ.list| grep "^TCGA" | while read line; do num=`zcat $id| grep -v '^#' | grep $line | wc -l`; echo "$line $num" >> TMB_READ.txt; done
配对样本如何计算TMB? 无配对样本如何计算TMB? 如果有小伙伴有相关经验，请拜托留下痕迹
id=TCGA.READ.muse.ec8ec3ad-f08d-46eb-9571-42806e304b37.DR...
id=TCGA.READ.muse.ec8ec3ad-f08d-46eb-9571-42806e304b37.DR...
tmb值与免疫检查点抑制剂疗效相关，而TCGA数据库中的tmb值可以通过TCGAmutations包来计算
panel target 测序来计算TMB，panel基因数目大于500个，region大于3M，组织样本去重后平...
0.肿瘤突变负荷(TMB)[http://222.70.95.243:6893/files/TMB/TMB.htm...
肿瘤突变负荷(TMB)计算 原文出处：https://mp.weixin.qq.com/s/xuwiZWl8hTV...
在前面系列教程中分享了如何下载TCGA表达矩阵（2022新版TCGA数据下载与整理[https://www.jia...
Stratification of additional genomic features by TMB and ...
背景： TMB是指肿瘤突变负荷（tumor mutation burden），TMB已显示出作为多种应用的预测性生...
本文标题：计算TMB
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/jleocctx.html
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