有个低级问题 为何要跨物种整合呢 单独比较不好吗

1问：有个低级问题 他们为何要跨物种整合呢 单独比较不好吗

1答:
部分基因在不同物种的名字有区别，所以要转换成相同的ID，再去整合分析，这样是准确性的保证。

2？ 谢谢 我的意思是 在单独一个物种分别分析不就好了 转换id整合也并不准确啊

我知道一种情况 整合好点 就是异种移植物 比如PDX小鼠 其他不知道有何必要性
2答：你说的单独分析是可以的，我有看到不少文献都是单独分析加整合分析双管齐下，并且比较两种分析产生的细胞类型是不是match。
整合起来分析，我觉得在作图时候，相对比较便捷吧。比如聚类，你做一次分析就知道细胞类型了，假设3个物种，单独分析，岂不是要重复三次。
而且，整合分析特别适合有些物种的细胞类型不是太确定，cell marker不明确这种情况。比如小鼠的这个器官已经研究很清楚了，人类和猴子还不知道，这个时候整合分析，mapping效果会比较好，帮助你分类。