1、PCA介绍
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是最常用的一种降维方法,通常用于高维数据集的探索与可视化,还可以用作数据压缩和预处理等。
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PCA可以把具有相关性的高维变量合成为线性无关的低维变量,称为主成分。主成分能够尽可能保留原始数据的信息。
->相关术语
在介绍PCA的原理之前需要回顾涉及到的相关术语:
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方差:
是各个样本和样本均值的差的平方和的均值,用来度量一组数据的分散程度。
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协方差:
用于度量两个变量之间的线性相关性程度,若两个变量的协方差为0,则可认为二者线性无关。
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协方差矩阵
协方差矩阵则是由变量的协方差值构成的矩阵(对称阵)。 -
特征向量和特征值
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矩阵的特征向量是描述数据集结构的非零向量,并满足如下公式:,A是方阵, v->是特征向量,lamda是特征值。
->算法原理
矩阵的主成分就是其协方差矩阵对应的特征向量,按照对应的特征值大小进行排序,最大的特征值就是第一主成分,其次是第二主成分,以此类推。
image.png2、实例编写
->实验目标
已知鸢尾花数据是4维的,共三类样本。使用PCA实现对鸢尾花数据进行降维,实现在二维平面上的可视化。
->鸢尾花数据集介绍
鸢尾花数据集采集的是鸢尾花的测量数据以及其所属的类别。
测量数据包括:萼片长度、萼片 宽度、花瓣长度、花瓣宽度。
类别共分为三类:Iris Setosa, Iris Versicolour,Iris Virginica。该 数据集可用于多分类问题。
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使用sklearn.datasets. load_iris即可加载相关数据集 其参数有:
- return_X_y:若为True,则以(data, target)形式返回数 据;默认为False,表示以字典形式返回数据全部信息(包括 data和target)。
示例:
>>> from sklearn.datasets import load_iris >>> iris = load_iris()
>>> print(iris.data.shape)
(150, 4)
>>> print(iris.target.shape)
(150, )
>>> list(iris.target_names) ['setosa', 'versicolor', 'virginica']
->sklearn中的PCA
在sklearn库中,可以使用sklearn.decomposition.PCA加载PCA进行 降维,主要参数有:
- n_components:指定主成分的个数,即降维后数据的维度
- svd_solver :设置特征值分解的方法,默认为‘auto’,其他可选有
‘full’, ‘arpack’, ‘randomized’。
代码:
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.datasets import load_iris
import numpy as np
data = load_iris()
y = data.target#使用y表示数据集中的标签
X = data.data#使用X表示数据集中的属性数据
pca = PCA(n_components=2)#加载PCA算法,设置降维后主成分数目为2
reduced_X = pca.fit_transform(X)#对原始数据进行降维,保存在reduced_X中
red_x, red_y = [], []
blue_x, blue_y = [], []
green_x, green_y = [], []
for i in range(len(reduced_X)):
if y[i] == 0:
red_x.append(reduced_X[i][0])
red_y.append(reduced_X[i][1])
elif y[i] == 1:
blue_x.append(reduced_X[i][0])
blue_y.append(reduced_X[i][1])
else:
green_x.append(reduced_X[i][0])
green_y.append(reduced_X[i][1])
plt.scatter(red_x, red_y, c='r', marker='X')
plt.scatter(blue_x, blue_y, c='b', marker='D')
plt.scatter(green_x, green_y, c='g', marker='.')
输出
image.png
可以看出,降维后的数据仍能够清晰地分成三类。 这样不仅能削减数据的维度, 降低分类任务的工作量,还 能保证分类的质量。
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