美文网首页BS-seq
bismark_methylation_extractor提取甲

bismark_methylation_extractor提取甲

作者: 热衷组培的二货潜 | 来源:发表于2018-12-10 18:38 被阅读6次

运行到这里遇到一个巨坑

sambamba

image.png
image.png
bismark erro
image.png
bismark DNA甲基化测序比对-bisulfite-seq
image.png

好吧本来想将两个repeat的bam文件合到一起,想着sambamba快一些,还脑残的进行了排序,结果自然而然merge后得到的bam文件运算时候就报错了。GG又折腾了一天。对于合并bam文件网上搜到的答案是尽量使用samtools cat, 而不影响原本bismark比对得到的bam文件的排布。

相关文章

网友评论

    本文标题:bismark_methylation_extractor提取甲

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/kaudhqtx.html