bismark_methylation_extractor提取甲
作者:
热衷组培的二货潜 | 来源:发表于
2018-12-10 18:38 被阅读6次运行到这里遇到一个巨坑
sambamba
![](https://img.haomeiwen.com/i6223615/d590bb5624c22064.png)
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![](https://img.haomeiwen.com/i6223615/d23f2df3ec7315af.png)
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bismark erro
![](https://img.haomeiwen.com/i6223615/72021731b3f306ef.png)
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bismark DNA甲基化测序比对-bisulfite-seq
![](https://img.haomeiwen.com/i6223615/929b461bab2d6f23.png)
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好吧本来想将两个repeat的bam文件合到一起,想着sambamba快一些,还脑残的进行了排序,结果自然而然merge后得到的bam文件运算时候就报错了。GG又折腾了一天。对于合并bam文件网上搜到的答案是尽量使用samtools cat
, 而不影响原本bismark比对得到的bam文件的排布。
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