一、在Linux里面安装软件第一步安装conda

用到miniconda，要选自己服务器匹配的最新版本的安装。自己的服务器要用uname -a这个命令来查看。我用的服务器是x86_64的——Miniconda3-py39_4.11.0-Linux-x86_64.sh这个是我要的。
用下面代码下载该文件到我服务器的biosoft文件夹下。
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.11.0-Linux-x86_64.sh

下载后，用bash Miniconda3-py39_4.11.0-Linux-x86_64.sh进行安装，中间出现的各种提问均用按Enter或者输入yes来对付。一直到出现：“Thank you for installing Miniconda3!”
最后输入source ~/.bashrc，来激活conda。
之后添加镜像

# 使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

二、用conda安装软件

1，查看已经有的软件用命令conda list
2，安装软件用命令conda install fastqc -y,是要安装名为fastqc的软件，所有弹出都回答为y（yes）。
3，查看是否安装成功fastqc --help
4，删除软件用命令conda remove fastqc -y