ntSynt 鉴定基因组共线性区块，并可视化

ntSynt -t 30 -d 5  A.ZG  B.ZG  C.ZG  D.ZG  E.ZG  F.ZG  G.ZG  H.ZG

然后得到 ntSynt.k24.w1000.synteny_blocks.tsv

使用 NGenomeSyn -InConf fig -OutPut 画“共线性图”

SetParaFor = global
#########   基因组信息 ########
GenomeInfoFile1=A.ZG.fai
GenomeInfoFile2=B.ZG.fai
GenomeInfoFile3=C.ZG.fai
GenomeInfoFile4=D.ZG.fai
GenomeInfoFile5=E.ZG.fai
GenomeInfoFile6=F.ZG.fai
GenomeInfoFile7=G.ZG.fai
GenomeInfoFile8=H.ZG.fai


#   link文件 
LinkFileRef1VsRef2=A_Bsyri.out
LinkFileRef2VsRef3=B_Csyri.out
LinkFileRef3VsRef4=C_Dsyri.out
LinkFileRef4VsRef5=D_Esyri.out
LinkFileRef5VsRef6=E_Fsyri.out
LinkFileRef6VsRef7=F_Gsyri.out
LinkFileRef7VsRef8=G_Hsyri.out