2020年2月4日 [Mol Ther Nucleic Acids.]杂志在线发表了上海中医药大学龙华医院中加消化系统疾病研究中心 Guang Ji 等学者的最新研究成果，综合的RNA测序腺瘤-癌变转换确定了人类结肠癌的预测生物标记物和治疗靶标。
摘要
前人的研究已经确定了预测大肠腺瘤向癌症转变的特定分子生物标记物，但是，与环状RNA（circRNA）相关的标记尚待阐明。我们进行了高通量RNA测序，以确定circRNA，microRNA（miRNA）和mRNA在人大肠癌（CRC），腺瘤和邻近正常组织中的表达情况。我们鉴定出与正常组织相比，在CRC和腺瘤组织中通常差异表达的84个circRNA，41个miRNA和398个mRNA。基因本体论（GO），京都基因与基因组百科全书（KEGG）途径以及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析确定了许多与癌症相关的中枢基因，这些基因可能成为CRC的潜在治疗靶标。构建了包括三个circRNA，三个miRNA和28个mRNA在内的竞争性内源RNA（ceRNA）网络，表明它们在癌症进展中的潜在作用。代表性的差异表达RNA已通过癌症基因组图谱（TCGA）数据库和实时PCR实验验证。接收者操作特征（ROC）曲线分析确定了三种circRNA（hsa_circ_0049487，hsa_circ_0066875和hsa_circ_0007444），它们可能是预测从结肠腺瘤向癌症转变的新型生物标记。总体而言，我们的发现可能提供新颖的观点，以阐明从恶变前腺瘤向癌症的转变机制，并鉴定与特定circRNA相关的特征，并可能用于早期诊断CRC和作为CRC的潜在治疗靶标。
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