从UCSC主页进去,点击tools,选择table browser,按照下图选择参数,最后导出数据即可。
一个背景哺乳动物基因组CpG位点通常集中在称为CpG岛(CpG island,CGI)的区域中,并且已知人基因启动...
CpG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,CpG保持或高于正常概率。CpG岛主要位于基因的...
来源:https://baike.baidu.com/item/CpG%E5%B2%9B/4811316?fr=a...
来源:https://www.jianshu.com/p/b97c64e16bf3[https://www.jia...
可以从官网获得BED文件 http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables?comm...
UCSC https://genome.ucsc.edu/ 1.搜索目标基因,点击条目进入详细信息。 2.拉到下...
XenaR包提供了一个简单的UCSC Xena接口,可以获取一些UCSC Xena存储的信息,包括GDC、TCGA...
简单的例子 运行结果如下: 如此根据染色体序号循环即可得到保存整个基因组的CpG位点的RData。 Biostri...
网址 https://genome.ucsc.edu/ UCSC Genome Browser: UCSC基因组...
本文标题:从UCSC获得CpG island信息
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/krraartx.html
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