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UCSC Genome Browser数据库

UCSC Genome Browser数据库

作者: 阿尔法约塔 | 来源:发表于2020-06-18 17:22 被阅读0次

    ​网址

    https://genome.ucsc.edu/

    UCSC Genome Browser:

    UCSC基因组浏览器是由Universityof California Santa Cruz(UCSC)基因组学研究所的跨部门团队Genome Bioinformatics Group开发和维护。该网站已发展为包括大量的脊椎动物和模型生物的装配体和注释信息,以及用于查看、分析和下载数据的大量工具。

    UCSC Genome Browser功能:

    基因组可视化、查询序列或基因、丰富的Tracks(基因组序列上对应区域的各种注释信息,包括表型与文献、mRNA与表达序列标签EST、基因表达、调控、比较基因组学、SNP位点、重复序列等)、以文本格式检索与Track相关的数据(Table Browser)、基因功能介绍(Gene Sorter)、序列比对(blat)、模拟PCR(In-SilicoPCR)、不同版本基因组间染色体位置转换(LiftOver)、查找启动子序列、数据下载等。

    英文版操作指南

    https://www.nature.com/scitable/ebooks/guide-to-the-ucsc-genome-browser-16569863/contents/

    中文版操作指南

    https://wenku.baidu.com/view/55edd1be3868011ca300a6c30c2259010302f338.html?fr=search

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