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2018-09-13 批量md5sum 检测ENA和NCBI r

2018-09-13 批量md5sum 检测ENA和NCBI r

作者: 小郑的学习笔记 | 来源:发表于2018-09-13 10:11 被阅读0次

    只有实战的时候,才会发现各种问题。
    之前编写好了从NCBI 和ENA高速下载几个T的文件的脚本,本来以为下完就可以安心跑数据了,结果下载下来的文件都大都不能被软件识别,一查md5,可能是断点续传导致的,反正就是时间白花了,这个时候对文件进行批量MD5check 就很必要,与从ENA网上下载的md5数据比较,就能知道自己下载的是否正确了。

    这里先来一个linux 下批量检测的md5的命令

    find ./ -type f -print0 | xargs -0 md5sum > ./my.md5

    测试一下

    OK 可以使用


    md5

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