操作步骤太多了。。。读者感兴趣可以去公众号查看。
基本简介 原始数据(Raw data)指测序下机后未经处理的全部原始数据文件,SRA是NCBI中收录原始数据的主要...
从NCBI上下载SRA原始数据,使用SRA TOOLKIT 进行下载和转化。 1. 下载SRA Toolkit (...
文章发表一般要求将测序数据上传至NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库。上传到NCB...
高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库。当我们需要...
在NGS基础:测序原始数据下载一文中提到可以使用SRA-toolkit中的命令fastq-dump从NCBI下载原...
随着测序技术的发展,每天都会有不少的测试数据上传到NCBI SRA等的数据库上,但是如果快速稳定的下载上传好的数据...
背景 上次提到根据SRA登录号从NCBI下载原始数据,是利用shell脚本下载测序数据,但是经常能碰到一些数据没有...
写在前面 伴随高通量测序技术的普及,海量的测序数据被产生并上传到网络数据库,如NCBI SRA。我们每个人都可以很...
注:不同类型数据上传不同数据库,此处微生物多样性的上传SRA。测序报告书上有。 https://mp.weixin...
2021/03/25 一、测序数据下载 NCBI SRA 数据库 【使用说明[https://trace.ncbi...
本文标题:(收藏贴)微生物多样性测序原始数据(SRA)上传到NCBI实操
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