想要过表达一个基因，在NCBI GENE的mRNA找到第一条序列，复制CDS区域到snapgene，发现一共有688个氨基酸。但是文献中有693个氨基酸。
解决方法：先看uniport，发现uniport中定义了最经典的那个蛋白质序列：
基于此，找到Refseq：
选择最经典那个氨基酸序列对应的mRNA序列即可
想要过表达一个基因，在NCBI GENE的mRNA找到第一条序列，复制CDS区域到snapgene，发现一共有688个氨基酸。但是文献中有693个氨基酸。
解决方法：先看uniport，发现uniport中定义了最经典的那个蛋白质序列：
基于此，找到Refseq：
开放阅读框预测 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/ 复制氨基酸序列 用...
一、学会用PubMed/NCBI等搜索数据库 1. 通过名字了解一个蛋白 当我们得到一个氨基酸序列，通过blast...
cds文件：注释信息里的蛋白编码序列pep文件：cds对应序列翻译成的氨基酸序列从NCBI上下载基因组时，有的并没...
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BLAST 序列比对 通过BLAST，可以快速的从数据库中，找到和已知序列最相似的序列。uniprot，ncbi，...
第一、去NCBI下载不同物种的同一蛋白质的氨基酸序列，保存为FAST A格式； 第二、利用clustal W软件进...
一：端粒蛋白质序列中氨基酸出现的频率 二：DNA序列中碱基出现的频率 三：一次一个残基地打印出氨基酸序列
序列比对和序列特征分析总目录 1 NCBI Protein database related informatio...
将一个或多个序列写入FASTA格式的文件中，包括核酸序列和氨基酸序列。在R语言中，需要seqinr package...
写在前面，假设已经得到了最佳模型（根据AIC） Charset 氨基酸序列矩阵 gamma shape和propo...
本文标题：关于NCBI gene-CDS得到的氨基酸序列和文献中的不一致
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/lbeyqdtx.html
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