美文网首页生信在线数据库
1️⃣序列获取(3):蛋白质序列获取

1️⃣序列获取(3):蛋白质序列获取

作者: Y大宽 | 来源:发表于2019-01-22 09:06 被阅读46次
    序列比对和序列特征分析总目录

    1 NCBI Protein database


    related information可以查看非常详细的各种相关信息

    2 EXProt :database for EXPerimentally verified Protein functions

    ps,写到这里,安利一个航母网址https://www.expasy.org/

    3 UniProtKB:不能再详细

    Swiss-Prot

    数据来源

    • 核酸数据库翻译推导
    • 蛋白质数据库PIR挑选
    • 科学文献摘录
    • 研究人员直接提交的蛋白序列

    特点

    • 每一条序列包括核心数据和注释两类,其中
      核心数据包括序列,参考文献,分类信息等
      注释数据包括功能描述,翻译后修饰,结构域和功能位点,四级结构,相关疾病,PPI等
    • 融合多个数据库,降低冗余
    • 与其它数据库交叉引用

    4 PIR

    The Protein Information Resource (PIR) is an integrated public bioinformatics resource to support genomic, proteomic and systems biology research and scientific studies (Wu et al., 2003).

    PIR

    5 MIPS比较全面的一个网站 参考文章

    ps:内嵌

    相关文章

      网友评论

        本文标题:1️⃣序列获取(3):蛋白质序列获取

        本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/ysbkjqtx.html