blastn跟blastp用法（linux）

作者: geneonto | 来源:发表于2022-05-06 17:10 被阅读0次

blastn跟blastp用法（linux）
biostar第八课 Blast
如何在blast结果中添加详细的物种信息
blastn的用法
windows本地BLAST（二）：操作及应用
BLAST -help
2022-03-07
用blast进行短序列（20nt左右）的搜索
2020-04-04
adb 实际工作高频用法

blastn

makeblastdb -in a.fasta -dbtype nucl -out a_db     #建立参考核苷酸序列索引
blastn -query b.fasta -db a_db -evalue 1e-10 -outfmt 6 -max_target_seqs 6 -out result     #-evalue为阈值，-outfmt为输出格式，-max_target_seqs为最大匹配基因对个数

blastp

makeblastdb -in a.fasta -dbtype prot -out a_db          #建参考蛋白序列索引
blastp -query b.fasta -db a_db -evalue 1e-10 -outfmt 6 -out result -max_target_seqs 6  #比对分析

blastn跟blastp用法（linux）
blastn blastp
biostar第八课 Blast
Blast Blast有好几个工具，blastn,blastp,blastx还有tblastn，tblastx b...
如何在blast结果中添加详细的物种信息
之前无论是做blastn或者是blastp都是仅仅在blast结果中显示了种属信息，没有添加详细的信息，添加种属信...
blastn的用法
方法参考：https://blog.csdn.net/likelet/article/details/756742...
windows本地BLAST（二）：操作及应用
以blastn用法为例: 1、建索引： makeblastdb -dbtype nucl -in ref.fast...
BLAST -help
blastp -help USAGE blastp [-h] [-help] [-import_search_s...
2022-03-07
请问大家什么叫做bidirectional blastp，这个bidirectional blastp和blast...
用blast进行短序列（20nt左右）的搜索
一句话概括就是：blastn多加上-task blastn-short -word_size 7 -evalue ...
2020-04-04
Linux Expect 用法关键字解释： spawn交互程序开始后面跟命令或者指定程序 expect获取匹配信...
adb 实际工作高频用法
adb 命令和 Linux 命令用法很相似，通过 adb shell 进入命令行后，用法基本和linux命令没有什...