虽然单细胞表观组学如scATAC技术已经十分成熟，但并没有像单细胞转录组一样分析方法那么多，讨论的也不多。
通过资料整理，目前常用的scATAC技术分析软件为AchR、Signac、Snap,这三个软件我都有下载并学习使用，最终发现AchR是最好用的，能做的分析最多，学习过程最为流畅；
我本想尝试使用Signac也进行分析，但总是很多bug出现，最终虽然能通过再github上找答案，但这个软件还在不断的优化过程中。因此推荐大家用AchR.
虽然单细胞表观组学如scATAC技术已经十分成熟，但并没有像单细胞转录组一样分析方法那么多，讨论的也不多。
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本文标题：scATAC-seq分析主要软件
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