作者：白介素2

前段时间，有位小伙伴问了我一个问题：
小伙伴：老哥，你知道有什么可以把免疫相关基因挑出来的数据库吗？
白介素同学：刚找到一个，送给你哈哈哈
这篇文章的内容就是上次送给小伙伴的数据库，分享给大家，说不定哪天就用上了呢。

有时候我们的研究只想关注免疫相关的基因，只对免疫感兴趣，想找到这些基因可咋办？总不能一个个去检索吧，这时候就需要一个数据库，将这部分大家感兴趣的信息通过专业的方法，总结打包起来做成一个数据库，供大家使用了。以下介绍下这个数据库的内容，有哪些功能：
数据库名称为 InnateDB，先看下数据库大概长啥样：

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大概的界面呢就是这样子，基本的情况呢包括检索功能，数据分析功能，注释功能，下载功能，还有其它资源的链接，还有关于数据库最基本情况的介绍，最后就是这个数据库发表的文章，最猛的就是著名的核酸研究杂志了，总共发了4篇文章。

检索功能

来看下检索功能与一般的其它数据库的区别，比如自己对一个基因感兴趣，可以输入检索看下，这里白介素同学用的CCL5作为测试，关于其它数据库都能做到的，比如基因的基本信息这些信息就不展示了，下面展示的是这个网站的特色，可以找到实验验证的互作关系对，而且标记出了其它分子的位置，比如细胞表面，核内等等。

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这些互作关系还可以直接导出下载，如果觉得图不好看，也可以直接导出到 cytoscape进行可视化，这个功能比较新颖了。另外就是也可以这种方式检索整个通路可能的互作，下面给出一个界面：

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其它的检索也类似，就不再做过多介绍，感兴趣的小伙伴自己稍微点击下就能熟悉。数据分析功能白介素同学觉得没什么特色，不做详细介绍了就。

注释功能

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固有免疫相关基因的注释，由于现有的关于固有免疫反应的GO****注释非常有限，于是这个团队呢就做了这个工作，总共注释了1693个固有免疫相关基因，并且呢现在还在进行，持续更新，现有的数据可以下载为Excel表格。

下载功能

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下载部分可以下载互作关系，包括实验验证的互作关系，固有免疫相关基因下载，都可以下载为文本文件格式，供大家用于自己的研究。

其它资源

这个其实才是重点，如何找到免疫相关基因？这一部分是以系列可供下载的 gene list，以下对这些 list一一进行介绍：

Immport

全称The Immunology Database and Analysis Portal，这个数据库里本来有6000多个免疫相关基因，专家从里面选出了4815个免疫相关基因，可供直接下载。

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Immunogenetic Related Information Source (IRIS)
1,535个来自IRIS网络数据库的免疫相关基因，

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Immunome Database

从研究论文，书籍，电子资源整理出的免疫相关基因，这些基因都直接参与了免疫相关过程，

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通过以上这些链接资源，想要回答如何把免疫相关基因找出来大概已经足够了吧，至于如何选择，更多细节还需要大家自行根据研究目的去查阅，也很简单，就是网页操作。
内容分享完了，白介素2同学祝大家学习愉快！

以下附上数据库链接地址：
https://www.innatedb.com/
参考文献资料：
Breuer et al., InnateDB: systems biology of innate immunity and beyond - recent updates and continuing curation. Nucl. Acids Res. (2013) 41 (D1)