WGCNA模块结果可视化,运用到的是Cytoscape软件,具体如下:
准备文件:
1.WGCNA导出的node与edge文件;
2.从node和edge文件中注释关注的TF与结构基因(注释包括基因名称,是否为TF),并整理至新的表格(fromnode与tonode都包括);
4.选中TF,右键Select选中,自动呈现圆形; 成圆
5.选中结构基因,操作同上;
6.选中其他基因,移动至圆形中央,即可完成初步图形。
自用颜色大小搭配:
结构基因 结构基因设置
其他基因 其他基因设置
Edge设置 Edge 效果图 成品图.png
本篇仅作记录,配色可自行搭配。
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