标本域,包含用于识别来自居民(患者或健康人)的生物标本的记录。
The specimen domain contains the records identifying biological samples from a person.
Field | Required | Type | Description |
---|---|---|---|
specimen_id | Yes | integer | A unique identifier for each specimen. |
标本-id | - | - | 每个标本的唯一标识符。 |
person_id | Yes | integer | A foreign key identifier to the Person for whom the Specimen is recorded. |
居民-id | - | - | 外键,记录标本对应居民的标识符。 |
specimen_concept_id | Yes | integer | A foreign key referring to a Standard Concept identifier in the Standardized Vocabularies for the Specimen. |
标本-概念-id | - | - | 外键,指向标本的标准词汇表中的标准概念标识符。 |
specimen_type_concept_id | Yes | integer | A foreign key referring to the Concept identifier in the Standardized Vocabularies reflecting the system of record from which the Specimen was represented in the source data. |
标本-类型-概念-id | - | - | 外键,指向标准词汇表中的概念标识符,反映在源数据中记录标本信息的来源系统。(译者按,此处需要确认,有可能是存储源数据中的数据元字段,例如'病理切片') |
specimen_date | No | date | The date the specimen was obtained from the Person. |
标本-日期 | - | - | 从居民体内采集标本的日期。 |
specimen_datetime | Yes | datetime | The date and time on the date when the Specimen was obtained from the person. |
标本-日期时间 | - | - | 从居民体内采集标本的日期和时间。 |
quantity | No | float | The amount of specimen collection from the person during the sampling procedure. |
数量 | - | - | 在取样过程中从居民体内采集的标本数量。 |
unit_concept_id | No | integer | A foreign key to a Standard Concept identifier for the Unit associated with the numeric quantity of the Specimen collection. |
单位-概念-id | - | - | 外键,指向单位的标准概念标识符,与采集标本的数量相关联。 |
anatomic_site_concept_id | Yes | integer | A foreign key to a Standard Concept identifier for the anatomic location of specimen collection. |
解剖-部位-概念-id | - | - | 外键,标识标本采集的解剖部位的标准概念的标识符。 |
disease_status_concept_id | Yes | integer | A foreign key to a Standard Concept identifier for the Disease Status of specimen collection. |
疾病-状态-概念-id | - | - | 外键,标识标本采集时的疾病状态的标准概念的标识符。 |
specimen_source_id | No | varchar(50) | The Specimen identifier as it appears in the source data. |
标本-源-id | - | - | 存储在源数据中的标本标识符。 |
specimen_source_value | No | varchar(50) | The Specimen value as it appears in the source data. This value is mapped to a Standard Concept in the Standardized Vocabularies and the original code is, stored here for reference. |
标本-源-值 | - | - | 源数据中存储的标本的值。此值会映射到标准词汇表中的标准概念,原始代码存储在此处以供参考。 |
unit_source_value | No | varchar(50) | The information about the Unit as detailed in the source. |
单位-源-值 | - | - | 源数据中存储的有关该单位的信息。 |
anatomic_site_source_value | No | varchar(50) | The information about the anatomic site as detailed in the source. |
解剖-部位-源-值 | - | - | 源数据中存储的有关解剖部位的信息。 |
disease_status_source_value | No | varchar(50) | The information about the disease status as detailed in the source. |
疾病-状态-源-值 | - | - | 源数据中存储的有关疾病状况的信息。 |
共识
No. | Convention Description | 共识 |
---|---|---|
1 | Anatomic site is coded at the most specific level of granularity possible, such that higher level classifications can be derived using the Standardized Vocabularies. | 解剖部位以尽可能最细的粒度级别编码,以便可以使用标准化词汇表导出更高级别的分类。 |
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