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46 - R中进行meta分析

46 - R中进行meta分析

作者: Hello育种 | 来源:发表于2022-06-15 16:06 被阅读0次

    来自:Luke Prendergast的报告

    提纲:

    image.png

    介绍:


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    汇报者的观点:


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    家庭作业:


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    会使用2个R包,metafor和meta

    image.png

    文章例子:

    image.png image.png image.png

    R代码

    读入数据


    image.png

    估计效应和方差:

    使用metafor

    image.png

    yi是效应,vi是方差(假设不同分组的方差相同)

    image.png

    forest

    image.png

    使用 meta包

    image.png

    图示:


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    第二部分-理论

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    fixed model

    image.png image.png

    增加权重:

    image.png
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    例子:

    image.png image.png image.png

    问题

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    固定效应:


    image.png

    使用随机模型

    image.png

    结果:


    image.png

    两个R包的使用

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    两种模型使用的tests不同

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    不能正确的输出REM的分析结果,解决方法如下:

    image.png
    image.png image.png

    4 错误的推断异质性

    image.png

    新的方法:


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    不同模型选择,会出现不同的结果:


    image.png
    image.png
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    第五个问题-查看每个试验的贡献

    image.png

    第6个问题- 使用哪一种estimator

    image.png

    解决:


    image.png

    测试:

    ![image.png](https://img.haomeiwen.com/i24959989/82d3595ab6931b54.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/](https://img.haomeiwen.com/i24959989/12fa9ba21b6ac5b9.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)

    第7个问题-发表文章的偏差

    image.png image.png

    参考文献:


    image.png

    forest()函数

    image.png

    新的软件sPLINK(https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-021-02562-1

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