gff to cds/pep

作者: 一直想要成为大牛的科研狗 | 来源:发表于2020-09-09 21:23 被阅读0次

已有基因组序列和gff3文件如何获得相关的cds和pep序列

# conda上安装cufflinks
# 根据gff提取cds
gffread in.gff3 -g ref.fa -x cds.fa
# 根据gff获得pep
gffread in.gff3 -g ref.fa -y pep.fa

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本文标题：gff to cds/pep

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