我们做转录组，蛋白组等组学，筛选差异表达的mRNA，lncRNA，circRNA，miRNA，蛋白，要面临一个问题。选什么样的阈值呢，|log2FC|>1，还是>0.58，同时p<0.05，还是使用padj<0.05。有些文献差异蛋白筛选，使用FC>1.2。这个阈值该怎么选择呢，到底什么样的阈值能够说明该分子有差异表达呢？
此外，我们可能会得到很多的差异基因，或者只有很少的差异基因，这种情况如何确定阈值。高分期刊，普通期刊文献一般是如何设置阈值的呢？
GO/KEGG等功能富集时会给出p值，padj值，这两个值怎么选，选哪个作为有效富集通路的阈值。
本期我们结合大量文献讨论上述阈值问题，给老师提供参考。
以下是视频录屏链接，有需要的老师可以观看。
B站 超清链接 ：
上：https://www.bilibili.com/video/BV1tV411v7tN
下：https://www.bilibili.com/video/BV1nv411h7d4
主要讨论内容：
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本文标题：转录组测序-组学实验如何设置阈值
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