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2021-10-06利用faSomeRecords根据基因ID提

2021-10-06利用faSomeRecords根据基因ID提

作者: 麦冬花儿 | 来源:发表于2021-10-06 23:48 被阅读0次

一、安装

从该网址下载其安装脚本：http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/

我一般都是保存在bin目录下，cd到该目录

运行命令行：

$ chmod +x faSomeRecords #赋予文件可执行权限，为Linux系统下执行

写到环境变量

echo export "PATH=~/bin/faSomeRecords/:$PATH" >> ~/.bashrc 

.     ~/.bashrc

vim 创作一个 保存基因名字的文件

faSomeRecords ref.pep.fasta id.txt query.fasta

#在该目录下存储着参考基因组的cds文件，即ref.pep.fasta

作者：blue_unique

链接：https://www.jianshu.com/p/ee9169478fca

來源：简书

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