对于FPKM表达数据时,Edger,limma,和deseq等算法并不合适。而ballgown是针对于FPKM数据...
高通量测序数据一般公司都会提供两种矩阵,一种是Row counts,前面说过的用于差异基因的筛选。第二种是FPKM...
DESeq2常常用于RNA-Seq数据分析,也有用于微生物组数据分析的。DESeq可以直接处理FPKM、FTPM、...
DESeq2常常用于RNA-Seq数据分析,也有用于微生物组数据分析的。 DESeq可以直接处理FPKM、FTP...
散列算法 散列算法一般用于生成数据的摘要信息,是一种不可逆的算法,一般适合存储密码之类的数据,常见的散列算法如MD...
limma分析差异基因 数据载入 多个探针求平均值 PCA plot Principal Component An...
简介 插入排序是一种用于排序的算法,该算法适合数据较少的应用场景(在后面介绍其他算法的时候会进行对比)。 算法原理...
require(ballgown) ## Create ballgown object: my.data=ball...
先加载fpkm的表达数据
总结(看的有限): 1. 大部分方法为基于深度(划分区间检测)的方法(FPKM、区域碱基数的类似FPKM算法)。 ...
本文标题:适合用于FPKM数据求差异基因的ballgown算法
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/oushyltx.html
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