模式生物拟南芥（A. thaliana）革新了我们对植物生物学的认识，影响了生命科学的许多方面。来源于拟南芥的知识也为作物的重要农艺性状提供了机械论的理解。拟南芥的基因组20年前就被测序，在基因组和表观遗传组上也对几百种自然变异株进行了分析。然而，作为大部分生物过程的主要执行者，拟南芥的蛋白质组还未被全面地描绘。
Mergner等人描绘了拟南芥30种组织的转录组、蛋白组和磷酸化蛋白组的定量图谱。初步回答了有多少基因能表达出蛋白，表达的部位，大约的数量，以及磷酸化的程度等问题。
对于植物领域的研究者来说，这些资源的交互式入口通过ProteomicsDB和ATHENA数据库提供。它们包含了探究和描绘拟南芥蛋白、修饰和互作的强大的生物信息学工具。
Title: Mass-spectrometry-based draft of the Arabidopsis proteome
Authors: Julia Mergner, Martin Frejno, Markus List, Michael Papacek, Xia Chen, Ajeet Chaudhary, Patroklos Samaras, Sandra Richter, Hiromasa Shikata, Maxim Messerer, Daniel Lang, Stefan Altmann, Philipp Cyprys, Daniel P. Zolg, Toby Mathieson, Marcus Bantscheff, Rashmi R. Hazarika, Tobias Schmidt, Corinna Dawid, Andreas Dunkel, Thomas Hofmann, Stefanie Sprunck, Pascal Falter-Braun, Frank Johannes, Klaus F. X. Mayer, Gerd Jürgens, Mathias Wilhelm, Jan Baumbach, Erwin Grill, Kay Schneitz, Claus Schwechheimer & Bernhard Kuster
Link: https://www.nature.com/articles/s41586-020-2094-2
DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-020-2094-2
Publication date: 2020/03/11
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