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在高通量单细胞测序实验中,单细胞悬液质量的好坏是实验成功与否的关键,但有些组织往往会因为结构复杂、细胞较大或不规则、脂肪或酶含量高、脆弱等原因,并不适合解离成单细胞悬液,这时往往会通过将组织制备成单细胞核悬液的方法来进行单细胞测序研究。
百奥医药团队累积了10,000+个样本的单细胞测序服务经验,涉及150+种不同类型的组织,具有丰富的新鲜组织解离的经验,在此基础上自主研发了细胞核悬液制备试剂盒。利用该试剂盒,能够高效的制备出高质量的单细胞核悬液。
百奥医药细胞核悬液制备试剂盒
1.产品介绍
本产品适用于人或其他哺乳动物的细胞悬液、新鲜组织及冻存组织等样本的细胞核的分离提取。本产品通过利用表面活性剂破坏细胞膜、释放细胞核并保持细胞核膜的稳定,经细胞筛过滤后得到干净的细胞核。制备的单细胞核悬液可用于单细胞核转录组测序、单细胞ATAC测序等相关实验。
2.测试效果
使用百奥医药细胞核悬液制备试剂盒将新鲜的小鼠脑和心肌组织制备成单细胞核悬液,取部分悬液利用CountStar全自动细胞荧光分析仪(AO/PI染色)检测悬液相关指标,同时取部分悬液进行台盼蓝染色然后镜检,观察细胞核完整度。对悬液进行10x Genomics平台单细胞建库测序,获取数据。
悬液质检结果:表1可以看出,制备的单细胞核悬液质量较高,核膜完整,结团率仅为3%左右,其他参数也均能满足高通量单细胞测序研究相关实验要求。
数据分析结果:从图4曲线图、捕获细胞数、测序深度、获得基因数结果初步可以看出,数据结果比较理想,脑和心肌组织中位基因数分别在2100和1600个左右,也较为理想。
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