众所周知,为了保证细胞悬液的质量,单细胞测序对样本新鲜度要求极高,如果采样后无法立即进行细胞悬液制备,如需要运输,或需要暂存与后续样本同批实验等,就需要对样本进行合适条件的保存/运输,否则可能无法保证样本最原始组织细胞状态,对后续结果产生一定影响。目前常用的方式是采用组织保存液储存组织样本,既可以保持样本最原始组织活性状态,又可以解决样本难以获取以及批次性效应等问题。
一、单细胞样本的麻烦事
1.少数样本上门实验性价比不高
如果单次实验样本数较少时选择上门实验,会使无效费用比例增加,进而导致上门实验性价比较低,该情况下,如果能够进行样本邮寄,既可提高效率又可降低费用。
2.不同时间段取样
由于特定取样安排或不同时间梯度设计等原因,如不同患者同类型样本不同时间手术取样,再如小鼠模型6h、8h、12h、18h、24h梯度取样。同一类型样本进行单细胞实验,尽量所有样本收集后同时处理,这样可减少批间差、人为误差、试剂误差等,因此,该情况最好能临时保存样本。
3.其他需要样本临时保存的情况
遇到手术时间不确定,难以提前预约准确取样时间,无法正常安排上门实验;取样后需要等待一段时间进行病理诊断选择样本取舍;没有合适的场地进行单细胞悬液制备等。
二、如何保存组织样本
美天旎组织保存液适用于多个时间点采样/不能及时处理样本时48h内的组织保存,不仅细胞得率高,而且活性强。实际上组织样本在保存液中存放一天后解离的效果和活性,包括后期单细胞测序数据所呈现的结果都具有很高的重复性。
美天旎组织保存液产品特征:MACS Tissue Storage Solution是一款经工艺优化后的全新组织保存液,该保存液能有效避免实验过程中的细胞活化、凋亡、坏死等现象,降低实验背景干扰。该产品广泛应用于人和鼠的肿瘤、皮肤、心脏、脾脏、大脑、骨骼肌肉等实验并获得可靠、优质结果。
应用优势:适用于多个组织或者不连续性组织样本处理过程;更有效保证干细胞功能性和免疫细胞的稳定性。
美天旎组织保存液处理过的组织解离后得到的细胞数基本高于其他品牌 美天旎组织保存液处理过的组织解离后的细胞活性明显高于其他品牌三、组织保存液如何使用
1.切取约200mg的组织(黄豆粒大小);
2.将获得的组织用PBS洗掉组织中的血液;
3.将洗后的组织样本放入加满组织保存液的离心管中,将离心管用封口膜密封好,放入合适的泡沫盒中;
4.生物冰袋是否添加及添加数量视天气情况而定,原则是保持样本在低温(0-4℃)状态,且不能冻住,运输时间须在48小时内,然后开展实验;
四、组织保存液使用案例
百奥医药具有丰富单细胞测序经验,已完成大量的组织保存液储存样本的细胞悬液制备实验,并得到高质量的单细胞悬液结果。
1.组织保存液保存24h-48h的穿刺癌组织细胞悬液制备结果
2.组织保存液保存<24h的穿刺癌组织细胞悬液制备结果
王俊杰、李超 | 文案
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