STAMP物种分布以及丰度的统计分析

相关文章

• 

  STAMP物种分布以及丰度的统计分析

  图中不同颜色代表不同的分组，物种构成在组间存在显著差异的分类以及在各组的比例，右侧是差异的比例和置信区间以及P-v...

• 

  宏基因组（Metagenome）测序分析常见问题十问十答

  1.Meta分析通过增加数据量是否可以组装出低丰度物种？ 在Metagenome 中，高丰度物种和低丰度物种分布的...

• 

  ggplot2版聚类物种丰度堆叠图

  在准备绘制不一样的物种丰度bar图在网上发现的一种可以绘制带有进化树，以及物种丰度的堆叠图 带有进化树物种丰度的堆...

• 

  在线作图丨差异分析——在线做Stamp分析

  Q1：什么是RDA分析？Stamp软件是一款用于组间差异分析的软件，适用于多种类型的组间差异分析，比如物种分布及丰...

• 

  在线作图|如何绘制一张星图

  物种丰度星图 星图是展现物种丰度的统计图之一，它与饼图类似，每块扇形面积大小代表物种丰度的大小，但不同的是，星图每...

• 

  4. 优势物种展示

  简介 优势物种展示。 数据样式：常见丰度表，列为样本，行为物种，交叉区域为各物种在各样本中的丰度。 一般堆叠柱状图...

• 

  物种丰度处理

  利用shell对物种丰度表进行处理： 1.原始丰度表如下： 每列由空格隔开，物种由分号隔开 处理如下：（注：处理完...

• 

  R可视化：使用R的circlize包绘制样本-物种丰度关联弦状图

  R作图-使用circlize绘制样本物种丰度关联弦状图 circlize图也即是弦图能较好展示样本物种丰度关联关系...

• 

  5. 基于OTUs的alpha多样性指数计算和可视化

  简介 1. 物种丰富度指数(Species richness)：群落中丰度大于0的物种数之和，一般用Observe...

• 

  β多样性计算的四种矩阵

  Bray_curtis——考虑物种有无和物种丰度， 不考虑各物种之间的进化关系或关联信息。 jaccard——只考...